L'hypothyroïdie résulte de la diminution ou de l'absence de production des hormones thyroïdiennes. Elle peut être due à une affection de la thyroïde (hypothyroïdie dite périphérique), sur laquelle est centrée cette Reco, ou à un déficit de stimulation hypophysaire (hypothyroïdie dite centrale).
Environ 50 % des hypothyroïdies périphériques sont auto-immunes (dont la thyroïdite de Hashimoto), environ 40 % sont secondaires au traitement d'une hyperthyroïdie (iode radioactif, chirurgie, antithyroïdiens de synthèse), environ 10 % ont pour causes la mauvaise observance de l'hormonothérapie thyroïdienne substitutive, une radiothérapie cervicale ou thoracique, les effets secondaires médicamenteux (lithium, amiodarone, interféron). L'hypothyroïdie d'origine centrale est liée à un déficit en TSH hypophysaire (voir Cas particuliers).
La prévalence de l'hypothyroïdie varie de 3 à 10 % en fonction des études et, surtout, des populations étudiées, avec une prédominance féminine (sex-ratio 2 à 3). La prévalence de l'hypothyroïdie infraclinique est plus élevée après 60 ans, ou en cas d'antécédents thyroïdiens ou de traitements à risque (amiodarone, lithium, interféron).
Le coma myxoedémateux est devenu une complication exceptionnelle d'une hypothyroïdie non traitée.