Elles sont favorisées par une défaillance immunitaire (diabète, corticothérapie générale, antibiothérapie, etc.). Trois groupes de champignons sont responsables de ces affections : les dermatophytes ont une affinité pour la peau et les phanères ; les levures (Candida et pityrospores) peuvent toucher la peau, les phanères et les muqueuses ; les moisissures sont responsables d'infections mixtes, d'onychomycoses, mais aussi de mycoses invasives profondes survenant principalement chez le sujet immunodéprimé.

Ce sont des infections très fréquentes. 22,8 % des obèses sont atteints de mycoses cutanéomuqueuses. Les onychomycoses représentent 50 % des onychopathies.

Les mycoses cutanéomuqueuses peuvent être à l'origine de surinfections bactériennes et d'infections mycosiques systémiques.