Toute prescription d'AINS impose une évaluation du rapport bénéfice/risque.

Elles sont multiples (voir Suivi et adaptation du traitement).

Les AINS sont contre-indiqués en cas d'ulcère gastroduodénal, d'insuffisance cardiaque ou rénale sévère. Les coxibs sont de plus contre-indiqués chez les patients « vasculaires ». Enfin, tous ont une contre-indication absolue à partir du 6e mois de grossesse.

Les plus fréquents sont les troubles fonctionnels digestifs (dyspepsie, gastralgies, nausées). Les EI digestifs graves sont notamment favorisés par les fortes doses, l'association de plusieurs AINS (contre-indiquée), leur utilisation prolongée, l'âge > 65 ans. Le risque hémorragique est accru par l'association aux anticoagulants, aux antiagrégants plaquettaires et, dans une moindre mesure, aux inhibiteurs de la recapture de la sérotonine (IRS). Les EI cutanéomuqueux sont fréquents : prurit, éruption cutanée, rhinite. Les AINS, particulièrement les oxicams, peuvent par ailleurs entraîner de très exceptionnelles mais gravissimes (mortalité d'environ 40 %) nécrolyses épidermiques toxiques ou NET (Stevens-Johnson, Lyell). Ils peuvent aussi être à l'origine d'une rétention hydrosodée, d'une élévation tensionnelle ou de la décompensation d'une cardiopathie. Les EI rénaux (insuffisance rénale, hyperkaliémie, protéinurie) sont majorés en cas de cardiopathie ou de néphropathie préexistantes, d'hypovolémie ou de traitement par diurétiques, inhibiteurs de l'enzyme de conversion (IEC) ou sartans.